Секретариатом Комиссии является Информационно-аналитический департамент по вопросам информационных систем и телекоммуникаций Кабинета Министров Республики Узбекистан.

Секретариат Комиссии:

- организует работу рабочего органа в части подготовки материалов и проведению заседаний Комиссии;

- организует контроль и мониторинг за исполнением решений Комиссии и представляет его результаты на рассмотрение заседания Комиссии;

- оформляет протоколы Комиссии и направляет утвержденные протоколы членам Комиссии, заинтересованным государственным органам;

- обеспечивает ведение делопроизводства Комиссии.